نهادينه سازی، طراحی و توسعه سیستم‌های شبکه  و سخت‌افزار دانشگاه علوم پزشکی در راس اهداف گروه زیرساخت قرار دارد. گروه زیرساخت به عنوان نگهدارنده و توسعه‌دهنده زیرساخت فناوری اطلاعات و ارتباطات دانشگاه، وظيفه تحليل، طراحي، توسعه، نگهداري و پشتيباني شبكه اينترنت و اينترانت دانشگاه علوم پزشکی مشهد را به عهده دارد. اجرای طرح‌های این واحد سبب ایجاد شبکه‌ای جامع با پوشش قریب به 100% کاربران و همچنين مدیریت متمرکز و کنترل شده شبکه و سرویس‌های تحت آن شده است. در این شبکه تمام کاربران امکان ارتباطی امن با یکدیگر را دارند و کليه ارتباطات در سطح دانشگاه  و تمام سرویس‌های تحت شبکه دانشگاه در این بستر به جریان می‌افتند. راه‌اندازی و پشتیبانی از سرویس‌هایی مانند پست الکترونیک، Skype for Business ، VPN و فعال‌سازی آنها برای کاربران از جمله فعالیت‌هایی است که به عهده این گروه است.